肝癌治療方式有（１）手術（２）血管栓塞（３）電燒加酒精注射（４）化學治療（5）光子刀或 質子刀。一：手術單獨一顆的肝癌比較適合開刀，由外科醫生使用開刀的方式，將腫瘤使用手術的方式切除，開刀的風險因人而異，一般原位腫瘤很適合作手術，但是手術必須考慮腫瘤的大小、位置、病人的年齡、手術的風險評估（心臟、血管、肺臟、肝臟的功能、肝臟的代邂能力、心肺功能、麻醉危險評估病人的肝機能）如果肝癌己經侵犯到肝門靜脈主幹，則不適宜開刀。
手術的危險必須經過評估，雖然手術可以一次切除腫瘤，但是風險評估是很重要的。二：血管栓塞，不適合動手術、病人本身拒絕開刀、血管栓塞的效果對小型肝癌（小於五公分）比較好，血管栓塞將肝癌附近的血管堵住，讓肝癌因為缺乏養份而自然壞死。三電燒加酒精注射：酒精注射就是利用純酒精能使肝細胞內的蛋白質凝固變質，造成肝細胞壞死這個原理。電燒其治療方法是在超音波導引下置入探針於肝腫瘤中心加以燒灼，利用無線電頻率加熱使腫瘤碳化，達到治療目的，由於它一次可燒灼三至五公分大的腫瘤，因此可以減少治療次數，其副作用與微波凝固治療類似。適應症也與微波凝固治療相同，適合腫瘤在三公分以下且不適合開刀的病人。四：化學治療，單藥化療，療效甚差，1年生存率僅為5.4%，沒有任何價值。聯合化療，可明顯提高療效，但效果也遠非理想。至今尚無一種藥物或聯合化療方案有效率超過20%，亦很少能延長生存期。化學治療最近已很少作的治療方式了。五：光子刀或 質子刀，光子刀台中澄清醫院有在作，台中澄清醫院與台大醫院再合作研發出最新的「BID肝癌光子刀治療法」，採取時間差攻擊法，一天兩次光子刀殺死肝癌，首批接受此療法的患者，有82﹪的存活率，有六成患者體內肝癌完全消失，創下國內罕見的肝癌治癒率。長庚、亞東醫院、有肝癌質子刀抗癌導航螺旋刀，質子治療其實也屬於癌症放射治療的一種，質子治療機釋放質子射線以治療腫瘤，而質子射線與X射線不同之處在於質子射線進入體內剛開始的距離並未釋放太多能量，但當行進至預設深度（例如設定出腫瘤的位置）之後，質子才會釋放大量放射能量並藉此殺死癌細胞，又當質子通過腫瘤後，其放射能量便立刻下降，因此就放射線之劑量分布而言，質子治療比傳統Ｘ射線放射治療（鈷六十治療或舊式直線加速）更有其優勢，質子治療較不易破壞腫瘤前後左右相鄰之正常組織，因此，適合治療腦瘤、顱底癌、眼癌、鼻咽癌、咽喉癌、肺癌、肝癌及攝護腺癌等。但質子治療並非萬能，只適合針對局部較小腫瘤作治療，對於全身性癌症如血癌、淋巴癌或其他各部位廣泛性侵犯的癌病並不適合。
手術的危險必須經過評估，雖然手術可以一次切除腫瘤，但是風險評估是很重要的。二：血管栓塞，不適合動手術、病人本身拒絕開刀、血管栓塞的效果對小型肝癌（小於五公分）比較好，血管栓塞將肝癌附近的血管堵住，讓肝癌因為缺乏養份而自然壞死。三電燒加酒精注射：酒精注射就是利用純酒精能使肝細胞內的蛋白質凝固變質，造成肝細胞壞死這個原理。電燒其治療方法是在超音波導引下置入探針於肝腫瘤中心加以燒灼，利用無線電頻率加熱使腫瘤碳化，達到治療目的，由於它一次可燒灼三至五公分大的腫瘤，因此可以減少治療次數，其副作用與微波凝固治療類似。適應症也與微波凝固治療相同，適合腫瘤在三公分以下且不適合開刀的病人。四：化學治療，單藥化療，療效甚差，1年生存率僅為5.4%，沒有任何價值。聯合化療，可明顯提高療效，但效果也遠非理想。至今尚無一種藥物或聯合化療方案有效率超過20%，亦很少能延長生存期。化學治療最近已很少作的治療方式了。五：光子刀或 質子刀，光子刀台中澄清醫院有在作，台中澄清醫院與台大醫院再合作研發出最新的「BID肝癌光子刀治療法」，採取時間差攻擊法，一天兩次光子刀殺死肝癌，首批接受此療法的患者，有82﹪的存活率，有六成患者體內肝癌完全消失，創下國內罕見的肝癌治癒率。長庚、亞東醫院、有肝癌質子刀抗癌導航螺旋刀，質子治療其實也屬於癌症放射治療的一種，質子治療機釋放質子射線以治療腫瘤，而質子射線與X射線不同之處在於質子射線進入體內剛開始的距離並未釋放太多能量，但當行進至預設深度（例如設定出腫瘤的位置）之後，質子才會釋放大量放射能量並藉此殺死癌細胞，又當質子通過腫瘤後，其放射能量便立刻下降，因此就放射線之劑量分布而言，質子治療比傳統Ｘ射線放射治療（鈷六十治療或舊式直線加速）更有其優勢，質子治療較不易破壞腫瘤前後左右相鄰之正常組織，因此，適合治療腦瘤、顱底癌、眼癌、鼻咽癌、咽喉癌、肺癌、肝癌及攝護腺癌等。但質子治療並非萬能，只適合針對局部較小腫瘤作治療，對於全身性癌症如血癌、淋巴癌或其他各部位廣泛性侵犯的癌病並不適合。
